Skip to content

Złośliwa transformacja Hymenolepis nana w ludzkim gospodarzu ad 5

2 miesiące ago

583 words

Usunięcie zanieczyszczających ludzkich sekwencji spowodowało 1,7 miliona pozostałych odczytów, z czego 1,4 miliona mapowano na genom referencyjny H. nana, z 53% pokryciem, przy średnim pokryciu 2,4 razy na zasadę (z wyłączeniem regionów o zerowym pokryciu). Z próbki kontrolnej H. nana mapowano 7,1 miliona odczytów, z 93% pokryciem, przy średnim pokryciu 7,0 razy na bazę. Figura 3. Figura 3. Strukturalne zmiany genomowe w H. nana.Panel A pokazuje pokrycie sekwencji w próbce biopsyjnej od pacjenta w porównaniu z kontrolą H. nana, wzdłuż długości rusztowania H. nana 1. Panele B i C pokazują złożone zmiany liczby kopii w zachowanych regionach genomowych zawierających zarówno eksony i 2 LAMP2. Groty strzałek wskazują sekwencje odczytu podzielonego, które są obecne w próbce od pacjenta, ale nie w próbce kontrolnej, wyniki są zgodne z chromosomowymi punktami przerwania. Panel D pokazuje insercyjne geny związane z mutacją, z danymi o ekspresji genów H. microstoma, porównującymi poziomy ekspresji u larw z tymi w różnych dorosłych tkankach; gwiazdki oznaczają poziomy ekspresji w tkankach dorosłych, które różnią się istotnie od poziomu ekspresji w tkance larwalnej.8 FPKM oznacza fragmenty na kilobazę transkryptu na milion mapowanych odczytów.
Amplifikacje wykrywano przez ocenę regionów genomowych, które miały zwiększone pokrycie w próbce biopsyjnej w porównaniu z próbką kontrolną. Obydwa egzony genu kodującego białko błonowe 2 związane z lizosomem (LAMP2), przewidywane na podstawie homologii z genomem H. microstoma z przypisami, 8,9 były obecne w dwóch z czterech największych nadreprezentowanych kontigów i rusztowań (zwiększonych o czynnik z 13 w jednym przypadku i 25 w drugim) (ryc. 3A, 3B i 3C). Wielokrotne sekwencje odczytu w obrębie tych konserwowanych regionów były obecne w próbce od pacjenta, ale nie w próbce kontrolnej, odkrycia, które są kompatybilne ze złożonym przegrupowaniem genomowym i amplifikacją. Podobne zmiany zaobserwowano w innych regionach bez przewidywanych genów homologicznych.
Analiza miejsca insercji zidentyfikowała sześć mutacji insercyjnych (tabela S2 w dodatkowym dodatku), z których pięć było związanych z genami kodującymi białka, przewidywanymi na podstawie homologii z H. microstoma. Przewidywane geny to regulator transkrypcji PHF10 / BAF45a (zaangażowany w rozwój), gen kodujący białkową kinazę ULK2 (zaangażowaną w autofagię), przypuszczalny czynnik transkrypcji palca cynkowego C2H2, gen kodujący IPP wiążący aktynę i gen kodujące nowe białko. Ssacze homologi trzech z tych genów – PHF10, ULK2 i IPP – badano na raka (Tabela Ponadto cztery z pięciu genów H. microstoma ulegają różnej ekspresji pomiędzy larwami i dorosłymi tkankami (rysunek 3D).
Dyskusja
Chociaż infekcje pozajelitowe H. nana są rzadkie, cysticerkoidy opisywano w preparatach pełnej krwi z dzieci leczonych glukokortykoidami [10], a przypadek śmiertelnego inwazyjnego zakażenia H. nana atypowymi cechami morfologicznymi opisano u człowieka zakażonego wirusem HIV.2, 3 Wiadomo, że H. nana rozwija nieprawidłowe, powiększone, balonizowane torbielaki u myszy z obniżoną odpornością.11,12 Normalny rozwój tasiemca prawdopodobnie wymaga sygnałów z odpowiedzi immunologicznych normalnych gospodarzy13, co jest dalej sugerowane przez kulturę in vitro tasiemców hydatidów.14 Nietypowe proliferacyjne infekcje innymi gatunkami tasiemca odnotowano także u ludzi2,15 i u innych zwierząt, w tym u orangutanów16 i kotów.17 W przeciwieństwie do obecnego przypadku, wszystkie wcześniej zgłoszone przypadki inwazyjnej cestodii wykazały rozpoznawalną architekturę tkanki metazowej.
Neoplastyczne proliferacje komórkowe występują u bezkręgowców 18, 19 i zostały opisane u płazińców o wolnym życiu20, ale zgodnie z naszą wiedzą takie proliferacje nie były wcześniej udokumentowane w pasożytach wielokomórkowych, w tym tasiemcach
[przypisy: stomatolog zielona góra, implanty zębów, dentysta Kraków ]

Powiązane tematy z artykułem: dentysta Kraków implanty zębów stomatolog zielona góra