Skip to content

Kompleksowa charakterystyka molekularna brodawkowego raka nerkowokomórkowego ad 7

2 miesiące ago

492 words

Ponadto zmniejszyła się ekspresja większości genów uczestniczących w cyklu Krebsa i kompleksu kinazy białkowej aktywowanego adenozyno-monofosforanem (AMPK), supresora syntezy kwasów tłuszczowych (Figura 3D). Dane dotyczące ekspresji białek G6PD, FASN i AMPK korelowały z danymi na temat ekspresji mRNA (rysunek 3D). Identyfikacja podgrup kręgosłupa brodawczaka nerkowokomórkowego za pomocą analizy wielopłaszczyznowej
Analiza skupień klastrów
Rycina 4. Rycina 4. Wykrywanie podtypu wieloplatformowego w brodawkowatym raku nerkowokomórkowym. Jak pokazano w panelu A, integracja klasyfikacji podtypów z pięciu platform danych genomowych za pomocą analizy klastrów zidentyfikowała cztery główne grupy brodawek. rak nerkowokomórkowy: C1 (wzbogacony o typ 1), C2a i C2b (wzbogacony o typ 2) i C2c (reprezentujący raki brodawkowate związane z CIMP). Mapa ciepła (środek panelu) wyświetla podtypy zdefiniowane niezależnie przez metylację DNA (różowy), liczbę kopii chromosomu (czarny), ekspresję mikroRNA (niebieski), ekspresję mRNA (czerwony) i białko (RPPA) (zielony); próbki z brakującymi danymi do wyrażenia białka są oznaczone kolorem szarym. Przedstawiono także cechy kliniczne związane z wieloplatformowymi podtypami. Panel B pokazuje różnice w całkowitym przeżyciu w zależności od podtypu. Dane dotyczące przeżycia nie były dostępne dla dwóch pacjentów w grupie C1.
Podobnie jak w przypadku analizy liczby kopii i analizy metylacji DNA, profile ekspresji mRNA i ekspresji mikroRNA oraz dane na temat ekspresji białka skupiły przypadki raka brodawkowatego na osobnych grupach z wyraźnymi ogólnymi wynikami (ryc. S11). , S12 i S13 w Uzupełniającym dodatku 1). Pięć typów danych połączono w celu przeprowadzenia analizy skupień klastrów 27, 28, która zidentyfikowała cztery skupiska guzów: C1 (wzbogacony w nowotwory typu 1), C2a i C2b (oba wzbogacone w nowotwory typu 2) i C2c (składający się wyłącznie z Związany z CIMP brodawkowaty rak nerkowokomórkowy) (Figura 4A).
Cluster C1 był głównie brodawkowatym rakiem nerkowokomórkowym typu i był silnie związany ze wzrostem chromosomu 7, mutacji MET, klastrem mRNA i wczesnym stadium rozwoju nowotworu (stadium I lub II) (Figura 4A i Fig. S14 w Dodatek dodatkowy 1). Cluster C2a był głównie brodawkowatym rakiem nerkowokomórkowym typu 2 i wiązał się z wczesnym stadium rozwoju nowotworu i klastrem metylacji DNA 2. Cluster C2b składał się wyłącznie z typów 2 i niesklasyfikowanych raków brodawkowatych brodawkowatych i był związany z klastrem metylacji DNA, późniejszy etap rozwoju nowotworu (stadium III lub IV) i mutacja SETD2. Podtyp nowotworu związany z CIMP, który obserwowano wcześniej w analizie metylacji DNA, został zachowany jako klaster C2c. Pacjenci z guzami typu C1 lub klastra C2a mieli najwyższe prawdopodobieństwo przeżycia całkowitego, pacjenci z guzami klasterowymi C2b mieli niższe prawdopodobieństwo, a pacjenci z guzami z grupy C2C mieli najniższe prawdopodobieństwo (Figura 4B).
Szlak NRF2-ARE w nowotworach typu 2
Przeprowadzono analizę szlaku w celu porównania sygnatur mikroRNA i mRNA guzów typu z guzami typu 2 (ryc.
[hasła pokrewne: oprogramowanie stomatologiczneia implanty, oprogramowanie stomatologiczne, dentysta Kraków ]

Powiązane tematy z artykułem: dentysta Kraków oprogramowanie stomatologiczne stomatologia implanty