Skip to content

Kompleksowa charakterystyka molekularna brodawkowego raka nerkowokomórkowego ad 6

1 miesiąc ago

531 words

Mutacja SETD2, BAP1 i PBRM1 w przypadku nowotworów typu 2
Nowotwory typu 2 były związane z mutacjami genów modyfikujących chromatynę SETD2, BAP1 i PBRM1, które często są mutowane w nerkach jasnokomórkowych nerki w połączeniu z utratą chromosomu 3p.21 Mutacje BAP1 i PBRM1 wzajemnie się wykluczały, ale PBRM1 mutacje często współwystępowały z mutacjami SETD2 (ryc. S9 w dodatkowym dodatku 1). Chociaż utrata chromosomu 3p była również związana z brodawkowatym rakiem nerkowokomórkowym typu 2, tylko 3 z 13 nowotworów typu 2 z mutacją SETD2, BAP1 lub PBRM1 wykazywały taką utratę i nie obserwowano hipermetylacji promotora (Fig. S9 w Dodatkowym dodatku ).
Fenotyp metylu fenotypu CpG (CIMP) w nowotworach typu 2
Rycina 3. Rycina 3. Podgrupa brodawkowatego raka nerkowokomórkowego, który ujawnia fenotyp metylacji CpG na wyspie (CIMP). Przedstawiony w panelu A podtyp molekularny za pomocą platformy metylacji DNA ujawnił trzy podtypy brodawkowatego raka nerek ( PRCC), z których jeden wykazał rozległe wzory hipermetylacji DNA charakterystyczne dla nowotworów związanych z CIMP (inne podtypy są identyfikowane jako klaster i klaster 2). Odpowiednie ścieżki danych podkreślają cechy molekularne związane z nowotworami CIMP (dziewięć przypadków), w tym wyciszanie CDKN2A, mutacje w linii płciowej lub somatycznej FH, stan histologiczny typu 2 i ekspresja genów związanych z kołem cyklu komórkowego23 i genów związanych z niedotlenieniem.24 Panel B pokazuje różnice w wieku pacjenta i przeżywalności ogólnej pomiędzy trzema podtypami. Dane dotyczące przeżycia nie były dostępne dla dwóch pacjentów w grupie 2. grupy. Panel C przedstawia wzory ekspresji RNA różnicowego (mRNA) dla kluczowych genów zaangażowanych w metabolizm PRCC, PRCC typu 1, PRCC typu 2 niezwiązanego z CIMP oraz prawidłową nerkę. Panel D pokazuje zróżnicowane wzorce ekspresji nowotworów związanych z CIMP w porównaniu z nowotworami typu w szlakach związanych z metabolizmem, ze szczególnym uwzględnieniem wzorców ekspresji genów i ekspresji białek, które wcześniej wiązały się z efektami podobnymi do Warburg a w przypadku raka nerki.21 Wartości P obliczono dla użycie testu t.
Dziewięć guzów (5,6%) miało podwyższoną metylację DNA w loci, które były niemetylowane w dopasowanej normalnej tkance. Stanowi to nowatorską CIMP22 związaną z nerkami, która obejmowała uniwersalną hipermetylację promotora CDKN2A (Figura 3A). Osiem z dziewięciu nowotworów było rakiem brodawkowatym typu 2. W pięciu nowotworach wykryliśmy mutację FH u linii zarodkowej lub somatycznej (56%). Stwierdzono zmniejszoną ekspresję mRNA FH i zwiększoną ekspresję genów związanych z progresją cyklu komórkowego i reakcją na niedotlenienie we wszystkich dziewięciu nowotworach (Figura 3A). Pacjenci z nowotworami związanymi z CIMP byli młodsi w momencie prezentacji i mieli mniejsze prawdopodobieństwo całkowitego przeżycia niż inni pacjenci z brodawkowatym rakiem nerkowokomórkowym (Figura 3B). Fumarowe guzy z niedoborem hydratazy typu 2 u pacjentów z dziedziczną leiomyomatozą i zespołem raka nerki charakteryzują się podobnym do Warburga metabolicznym przesunięciem w kierunku metabolizmu zależnego od glikolizy i zwiększoną ekspresją genów związanych z niedotlenieniem.25,26 Podobnie, CIMP- związane nowotwory wykazały zwiększoną ekspresję kluczowych genów zaangażowanych w glikolizę (HK1, LDHA i PDK1), szlak pentozofosforanowy (G6PD) i syntezę kwasów tłuszczowych (FASN) (Figura 3C i Fig.
[hasła pokrewne: stomatolog piaseczno, implanty zębów Kraków, dentysta bielsko ]

Powiązane tematy z artykułem: dentysta bielsko implanty zębów Kraków stomatolog piaseczno